La misión del Instituto Ecuménico de Bossey consiste en educar y formar a los líderes ecuménicos, tanto clérigos como laicos, para el servicio en las parroquias, aulas y centros ecuménicos de todo el mundo, y dar forma al pensamiento ecuménico a través de encuentros interculturales e interconfesionales, el estudio de programas en régimen de internado, el culto común y la vida en comunidad.

El Instituto Ecuménico está adscrito a la Facultad Autónoma de Teología Protestante de la Universidad de Ginebra desde 1952. La formación ecuménica que se imparte en Bossey fortalece, transforma y enriquece la identidad de los estudiantes, que proceden de dentro y fuera de la amplia esfera de influencia del CMI, y tiene como objetivo proporcionar un entorno de aprendizaje vibrante que fomente la pasión por el ecumenismo.

Por medio de la vida comunitaria, el estudio académico y el culto, Bossey ofrece una experiencia única de formación ecuménica en sus programas y encuentros académicos.