En la actualidad, los programas de formación continua para profesionales están adquiriendo cada vez más importancia como manera de adaptarse a contextos que cambian rápidamente.

El proyecto de formación ecuménica continua del CMI incluye programas de formación en materia de liderazgo a través de cursos acreditados de corta duración, así como seminarios, grupos de investigación y elaboración de recursos.  Los cursos y eventos pueden tener lugar tanto en el Instituto Ecuménico de Bossey como en el ámbito regional en diferentes lugares del mundo.

Los espacios seguros que se crean durante los cursos y el trabajo de los grupos permiten a los profesionales de las iglesias miembros, los asociados ecuménicos y las organizaciones internacionales, así como a todo aquel que desee ampliar sus conocimientos, discutir sobre las cuestiones acuciantes para el movimiento ecuménico en un mundo plurirreligioso.  En tanto que contribuciones para la peregrinación de justicia y paz, las actividades sirven para sensibilizar sobre las implicaciones ecuménicas de los cambios en el ámbito eclesiástico y social.

Todas las actividades se organizan en colaboración con las iglesias miembros del CMI y otros asociados ecuménicos, así como actores de la sociedad civil, organizaciones internacionales y diferentes equipos del CMI.